Школа богата историей, которую чтят и которой гордятся пошехонцы. Датой открытия школы считается 1867 год. Именно тогда ремесленник-купец из Санкт-Петербурга, уроженец деревни Ляча Никита Максимович Комаров из своего собственного дома, перевезённого к церкви, построил здание школы. Все расходы по содержанию учебного заведения он взял на себя. После смерти Никиты Максимовича в 1871 году школа закрылась за неимением средств к существованию.
В 1878 году родственник Никиты Максимовича крупный коммерсант из Санкт-Петербурга Меркурий Елизарович Комаров, уроженец деревни Кузовлево, купил при деревне Вощиково поместье с барским домом, лесом и угодьями, отделил участок земли в три десятины.
Здание закрывшейся школы перевезли на этот участок и построили дом для Александровского двуклассного училища, которое со 2 февраля 1880 года гостеприимно открыло свои двери для учеников. В первое время здесь занимались немногим более ста мальчиков и девочек. Учителем был назначен Сергей Феоктистович Любимов, позже ставший священником.
В 1884 году было освящено новое здание училища, двухэтажное, на каменном фундаменте.
За 20 лет деятельности училища в его стенах получили образование 539 мальчиков и 303 девочки.
В начале ХХ столетия в Вощиковской школе работал директором Павел Флегонтович Яхонтов, а учителями были его жена Юлия Ивановна, а также дочь священника, первого учителя Александровского училища отца Сергия Любимова, Елизавета Сергеевна.
Много добрых слов можно сказать и о последующих директорах школы. В 1950 году Павла Флегонтовича сменила его дочь Нина Павловна Яхонтова, которая занимала эту должность до 1961 года. Под её руководством проводилась большая опытническая работа на пришкольном участке. Школа была участницей ВДНХ, за что неоднократно награждалась почётными грамотами, а Нина Павловна, как руководитель, награждена орденом Ленина – высшей государственной наградой страны.
С 1961 по 1990 год директором школы была Евгения Николаевна Морозова. Основными чертами её характера были требовательность и справедливость. Много внимания она уделяла повышению качества обучения школьников. Евгения Николаевна отмечена значком «Отличник народного просвещения».
В 1990 году случилась большая беда – здание школы было полностью уничтожено пожаром. Одиннадцать лет дети учились в неприспособленном помещении. Новое здание школы было построено благодаря усилиям директора местного СПК «Прилив» Зинаиды Константиновны Финогеновой при большой поддержке тогдашнего губернатора области А. И. Лисицына. В 2001 году новая школа, уже в статусе средней, гостеприимно распахнула свои двери для учеников.
Вощиковская школа славится своими выпускниками, как знаменитыми, так и простыми тружениками. Здесь учились семь братьев Королёвых, которые все погибли в годы Великой Отечественной войны. Старшему, генерал-майору Александру Игнатьевичу Королёву, было присвоено звание Героя Советского Союза. В 1987 году при школе был открыт дом-музей братьев Королёвых.
Северный край